Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARRDC4Q8NCT1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARRDC4Q8NCT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARRDC4Q8NCT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARRDC4Q8NCT1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARRDC4Q8NCT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARRDC4Q8NCT1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARRDC4Q8NCT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARRDC4Q8NCT1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARRDC4Q8NCT1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARRDC4Q8NCT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARRDC4Q8NCT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARRDC4Q8NCT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARRDC4Q8NCT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
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