Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF169Q8NCN4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF169Q8NCN4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF169Q8NCN4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF169Q8NCN4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF169Q8NCN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF169Q8NCN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF169Q8NCN4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF169Q8NCN4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF169Q8NCN4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF169Q8NCN4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF169Q8NCN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF169Q8NCN4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms