Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC1AQ8NC01 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC1AQ8NC01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC1AQ8NC01 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLEC1AQ8NC01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC1AQ8NC01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC1AQ8NC01 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC1AQ8NC01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC1AQ8NC01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLEC1AQ8NC01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms