Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NHLRC2Q8NBF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NHLRC2Q8NBF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC2Q8NBF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC2Q8NBF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms