Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP11CQ8NB49 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP11CQ8NB49 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP11CQ8NB49 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP11CQ8NB49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP11CQ8NB49 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP11CQ8NB49 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP11CQ8NB49 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP11CQ8NB49 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP11CQ8NB49 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms