Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP38Q8NB14 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP38Q8NB14 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP38Q8NB14 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP38Q8NB14 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP38Q8NB14 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP38Q8NB14 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP38Q8NB14 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP38Q8NB14 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms