Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG16L2Q8NAA4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L2Q8NAA4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L2Q8NAA4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG16L2Q8NAA4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L2Q8NAA4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms