Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC89Q8N998 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC89Q8N998 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC89Q8N998 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC89Q8N998 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC89Q8N998 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC89Q8N998 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC89Q8N998 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms