Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMER3Q8N944 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMER3Q8N944 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMER3Q8N944 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMER3Q8N944 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMER3Q8N944 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMER3Q8N944 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AMER3Q8N944 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms