Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B6

PACRGL, PACRG-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGLQ8N7B6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACRGLQ8N7B6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACRGLQ8N7B6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACRGLQ8N7B6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACRGLQ8N7B6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACRGLQ8N7B6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACRGLQ8N7B6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACRGLQ8N7B6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms