Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3G9

TMEM130, Transmembrane protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM130Q8N3G9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM130Q8N3G9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM130Q8N3G9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM130Q8N3G9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM130Q8N3G9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM130Q8N3G9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM130Q8N3G9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM130Q8N3G9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms