Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC43Q8N309 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC43Q8N309 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC43Q8N309 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC43Q8N309 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC43Q8N309 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC43Q8N309 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC43Q8N309 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC43Q8N309 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC43Q8N309 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC43Q8N309 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC43Q8N309 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC43Q8N309 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC43Q8N309 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms