Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1C3

GABRG1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG1Q8N1C3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG1Q8N1C3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRG1Q8N1C3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRG1Q8N1C3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG1Q8N1C3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG1Q8N1C3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRG1Q8N1C3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRG1Q8N1C3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG1Q8N1C3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG1Q8N1C3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRG1Q8N1C3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG1Q8N1C3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRG1Q8N1C3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRG1Q8N1C3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRG1Q8N1C3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRG1Q8N1C3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms