Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD3Q8N144 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD3Q8N144 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD3Q8N144 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD3Q8N144 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD3Q8N144 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD3Q8N144 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD3Q8N144 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD3Q8N144 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD3Q8N144 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD3Q8N144 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD3Q8N144 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD3Q8N144 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms