Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CNTROBQ8N137 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTROBQ8N137 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CNTROBQ8N137 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNTROBQ8N137 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CNTROBQ8N137 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNTROBQ8N137 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CNTROBQ8N137 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNTROBQ8N137 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNTROBQ8N137 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CNTROBQ8N137 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CNTROBQ8N137 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CNTROBQ8N137 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNTROBQ8N137 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CNTROBQ8N137 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNTROBQ8N137 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CNTROBQ8N137 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CNTROBQ8N137 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CNTROBQ8N137 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNTROBQ8N137 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms