Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrdQ8K2M3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrdQ8K2M3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrdQ8K2M3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrrdQ8K2M3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrdQ8K2M3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrdQ8K2M3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrrdQ8K2M3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms