Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300eQ8K249 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd300eQ8K249 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300eQ8K249 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300eQ8K249 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd300eQ8K249 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd300eQ8K249 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd300eQ8K249 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd300eQ8K249 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300eQ8K249 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300eQ8K249 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cd300eQ8K249 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300eQ8K249 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd300eQ8K249 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd300eQ8K249 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.3 ms