Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx5Q8K1E0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx5Q8K1E0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx5Q8K1E0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx5Q8K1E0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx5Q8K1E0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx5Q8K1E0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx5Q8K1E0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms