Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lrit1Q8K099 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lrit1Q8K099 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lrit1Q8K099 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrit1Q8K099 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrit1Q8K099 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrit1Q8K099 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrit1Q8K099 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrit1Q8K099 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrit1Q8K099 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrit1Q8K099 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrit1Q8K099 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrit1Q8K099 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrit1Q8K099 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrit1Q8K099 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrit1Q8K099 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lrit1Q8K099 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrit1Q8K099 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrit1Q8K099 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lrit1Q8K099 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrit1Q8K099 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrit1Q8K099 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lrit1Q8K099 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrit1Q8K099 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrit1Q8K099 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrit1Q8K099 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrit1Q8K099 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lrit1Q8K099 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrit1Q8K099 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrit1Q8K099 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Lrit1Q8K099 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrit1Q8K099 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lrit1Q8K099 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrit1Q8K099 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrit1Q8K099 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrit1Q8K099 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms