Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIRREL3Q8IZU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIRREL3Q8IZU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIRREL3Q8IZU9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIRREL3Q8IZU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIRREL3Q8IZU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIRREL3Q8IZU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIRREL3Q8IZU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIRREL3Q8IZU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms