Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZR5

CMTM4, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4Q8IZR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM4Q8IZR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM4Q8IZR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMTM4Q8IZR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM4Q8IZR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM4Q8IZR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms