Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HACE1Q8IYU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HACE1Q8IYU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HACE1Q8IYU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HACE1Q8IYU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HACE1Q8IYU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HACE1Q8IYU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms