Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM2Q8IXS6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM2Q8IXS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALM2Q8IXS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM2Q8IXS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM2Q8IXS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PALM2Q8IXS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PALM2Q8IXS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALM2Q8IXS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PALM2Q8IXS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PALM2Q8IXS6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms