Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK2

GALNT12, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12Q8IXK2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GALNT12Q8IXK2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GALNT12Q8IXK2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNT12Q8IXK2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GALNT12Q8IXK2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GALNT12Q8IXK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GALNT12Q8IXK2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNT12Q8IXK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT12Q8IXK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GALNT12Q8IXK2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GALNT12Q8IXK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GALNT12Q8IXK2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT12Q8IXK2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT12Q8IXK2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT12Q8IXK2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNT12Q8IXK2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms