Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KSR1Q8IVT5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KSR1Q8IVT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KSR1Q8IVT5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KSR1Q8IVT5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KSR1Q8IVT5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KSR1Q8IVT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms