Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCD3Q8IVD9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCD3Q8IVD9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCD3Q8IVD9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCD3Q8IVD9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUDCD3Q8IVD9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUDCD3Q8IVD9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUDCD3Q8IVD9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUDCD3Q8IVD9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUDCD3Q8IVD9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUDCD3Q8IVD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCD3Q8IVD9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCD3Q8IVD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCD3Q8IVD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCD3Q8IVD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCD3Q8IVD9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCD3Q8IVD9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCD3Q8IVD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCD3Q8IVD9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCD3Q8IVD9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms