Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV16

GPIHBP1, Glycosylphosphatidylinositol-anchored high density lipoprotein-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPIHBP1Q8IV16 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPIHBP1Q8IV16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPIHBP1Q8IV16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPIHBP1Q8IV16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GPIHBP1Q8IV16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPIHBP1Q8IV16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPIHBP1Q8IV16 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPIHBP1Q8IV16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPIHBP1Q8IV16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPIHBP1Q8IV16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPIHBP1Q8IV16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms