Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNJLQ8IV13 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNJLQ8IV13 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNJLQ8IV13 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNJLQ8IV13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNJLQ8IV13 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNJLQ8IV13 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms