Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms