Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIA5

Slc35b4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b4Q8CIA5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc35b4Q8CIA5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc35b4Q8CIA5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35b4Q8CIA5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35b4Q8CIA5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35b4Q8CIA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35b4Q8CIA5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35b4Q8CIA5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35b4Q8CIA5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc35b4Q8CIA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35b4Q8CIA5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc35b4Q8CIA5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc35b4Q8CIA5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc35b4Q8CIA5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc35b4Q8CIA5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc35b4Q8CIA5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc35b4Q8CIA5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc35b4Q8CIA5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc35b4Q8CIA5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35b4Q8CIA5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.4 ms