Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox30Q8CGW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sox30Q8CGW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sox30Q8CGW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sox30Q8CGW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sox30Q8CGW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox30Q8CGW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox30Q8CGW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox30Q8CGW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox30Q8CGW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox30Q8CGW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox30Q8CGW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox30Q8CGW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox30Q8CGW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms