Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tshz3Q8CGV9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tshz3Q8CGV9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tshz3Q8CGV9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tshz3Q8CGV9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tshz3Q8CGV9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tshz3Q8CGV9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tshz3Q8CGV9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tshz3Q8CGV9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tshz3Q8CGV9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tshz3Q8CGV9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tshz3Q8CGV9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tshz3Q8CGV9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tshz3Q8CGV9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tshz3Q8CGV9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tshz3Q8CGV9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tshz3Q8CGV9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tshz3Q8CGV9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms