Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkiras1Q8CEC5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkiras1Q8CEC5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkiras1Q8CEC5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkiras1Q8CEC5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkiras1Q8CEC5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkiras1Q8CEC5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkiras1Q8CEC5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkiras1Q8CEC5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkiras1Q8CEC5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkiras1Q8CEC5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nkiras1Q8CEC5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkiras1Q8CEC5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkiras1Q8CEC5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms