Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc87Q8CDL9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc87Q8CDL9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc87Q8CDL9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc87Q8CDL9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc87Q8CDL9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc87Q8CDL9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc87Q8CDL9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc87Q8CDL9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc87Q8CDL9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc87Q8CDL9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc87Q8CDL9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc87Q8CDL9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms