Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vcpip1Q8CDG3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vcpip1Q8CDG3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vcpip1Q8CDG3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vcpip1Q8CDG3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vcpip1Q8CDG3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vcpip1Q8CDG3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vcpip1Q8CDG3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vcpip1Q8CDG3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vcpip1Q8CDG3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vcpip1Q8CDG3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Vcpip1Q8CDG3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vcpip1Q8CDG3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vcpip1Q8CDG3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms