Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vwa8Q8CC88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vwa8Q8CC88 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vwa8Q8CC88 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vwa8Q8CC88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vwa8Q8CC88 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vwa8Q8CC88 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa8Q8CC88 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vwa8Q8CC88 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vwa8Q8CC88 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vwa8Q8CC88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vwa8Q8CC88 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vwa8Q8CC88 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vwa8Q8CC88 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vwa8Q8CC88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vwa8Q8CC88 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Vwa8Q8CC88 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa8Q8CC88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa8Q8CC88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vwa8Q8CC88 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa8Q8CC88 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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