Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp11Q8CB67 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrp11Q8CB67 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrp11Q8CB67 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrp11Q8CB67 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrp11Q8CB67 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp11Q8CB67 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp11Q8CB67 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrp11Q8CB67 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms