Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bhlhe22Q8C6A8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Bhlhe22Q8C6A8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bhlhe22Q8C6A8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bhlhe22Q8C6A8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms