Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc90bQ8C3X2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc90bQ8C3X2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc90bQ8C3X2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc90bQ8C3X2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms