Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac7Q8C2B3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac7Q8C2B3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac7Q8C2B3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac7Q8C2B3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac7Q8C2B3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hdac7Q8C2B3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac7Q8C2B3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac7Q8C2B3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac7Q8C2B3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac7Q8C2B3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac7Q8C2B3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac7Q8C2B3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac7Q8C2B3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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