Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ska3Q8C263 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ska3Q8C263 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ska3Q8C263 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ska3Q8C263 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ska3Q8C263 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ska3Q8C263 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ska3Q8C263 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms