Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp38Q8BW70 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp38Q8BW70 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp38Q8BW70 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp38Q8BW70 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp38Q8BW70 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp38Q8BW70 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp38Q8BW70 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp38Q8BW70 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp38Q8BW70 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp38Q8BW70 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp38Q8BW70 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp38Q8BW70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms