Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Als2cr12Q8BVM7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Als2cr12Q8BVM7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Als2cr12Q8BVM7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Als2cr12Q8BVM7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Als2cr12Q8BVM7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Als2cr12Q8BVM7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Als2cr12Q8BVM7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Als2cr12Q8BVM7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms