Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp43Q8BUM9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp43Q8BUM9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp43Q8BUM9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp43Q8BUM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp43Q8BUM9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp43Q8BUM9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp43Q8BUM9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp43Q8BUM9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp43Q8BUM9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp43Q8BUM9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp43Q8BUM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp43Q8BUM9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 436 ms