Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY2

Slc4a7, Sodium bicarbonate cotransporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a7Q8BTY2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc4a7Q8BTY2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc4a7Q8BTY2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc4a7Q8BTY2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc4a7Q8BTY2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc4a7Q8BTY2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc4a7Q8BTY2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc4a7Q8BTY2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc4a7Q8BTY2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slc4a7Q8BTY2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slc4a7Q8BTY2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slc4a7Q8BTY2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc4a7Q8BTY2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc4a7Q8BTY2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc4a7Q8BTY2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc4a7Q8BTY2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc4a7Q8BTY2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc4a7Q8BTY2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc4a7Q8BTY2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc4a7Q8BTY2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slc4a7Q8BTY2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc4a7Q8BTY2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc4a7Q8BTY2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc4a7Q8BTY2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 720.4 ms