Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gga3Q8BMI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gga3Q8BMI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gga3Q8BMI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gga3Q8BMI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gga3Q8BMI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gga3Q8BMI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gga3Q8BMI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gga3Q8BMI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gga3Q8BMI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gga3Q8BMI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gga3Q8BMI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gga3Q8BMI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gga3Q8BMI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms