Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prox2Q8BII1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prox2Q8BII1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prox2Q8BII1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prox2Q8BII1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prox2Q8BII1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prox2Q8BII1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prox2Q8BII1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prox2Q8BII1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox2Q8BII1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prox2Q8BII1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prox2Q8BII1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prox2Q8BII1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prox2Q8BII1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prox2Q8BII1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms