Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH00

Aldh8a1, Aldehyde dehydrogenase family 8 member A1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh8a1Q8BH00 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Aldh8a1Q8BH00 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Aldh8a1Q8BH00 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Aldh8a1Q8BH00 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Aldh8a1Q8BH00 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Aldh8a1Q8BH00 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Aldh8a1Q8BH00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Aldh8a1Q8BH00 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Aldh8a1Q8BH00 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Aldh8a1Q8BH00 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aldh8a1Q8BH00 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aldh8a1Q8BH00 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aldh8a1Q8BH00 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Aldh8a1Q8BH00 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Aldh8a1Q8BH00 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Aldh8a1Q8BH00 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Aldh8a1Q8BH00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Aldh8a1Q8BH00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms