Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW7

Lpp, Lipoma-preferred partner homolog, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LppQ8BFW7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LppQ8BFW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LppQ8BFW7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LppQ8BFW7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LppQ8BFW7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LppQ8BFW7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LppQ8BFW7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LppQ8BFW7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LppQ8BFW7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LppQ8BFW7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LppQ8BFW7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LppQ8BFW7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LppQ8BFW7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LppQ8BFW7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LppQ8BFW7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LppQ8BFW7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LppQ8BFW7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LppQ8BFW7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LppQ8BFW7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LppQ8BFW7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LppQ8BFW7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LppQ8BFW7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LppQ8BFW7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LppQ8BFW7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LppQ8BFW7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LppQ8BFW7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LppQ8BFW7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LppQ8BFW7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LppQ8BFW7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LppQ8BFW7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LppQ8BFW7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LppQ8BFW7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LppQ8BFW7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LppQ8BFW7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LppQ8BFW7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LppQ8BFW7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LppQ8BFW7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LppQ8BFW7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LppQ8BFW7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LppQ8BFW7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LppQ8BFW7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 715.8 ms