Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HAPLN4Q86UW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAPLN4Q86UW8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HAPLN4Q86UW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HAPLN4Q86UW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1227.9 ms